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更新于 2026-10-06

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其中N是接触总数,Δ Si,j是序列分离,即在氨基酸残基i和j之间的序列差, L是蛋白质中的残基总数。对于单结构域蛋白质,接触序的值通常在 5% 到 25% 之间,较低的接触序主要属于螺旋蛋白质,较高的接触序属于具有高 β-片层含量的蛋白质。

蛋白质结构预测方法在预测具有低接触序的蛋白质结构方面更准确。这可能部分是因为低接触序的蛋白质往往很小,但可能是由于在最小化能量函数的全局优化过程中要考虑的可能的远程残基-残基相互作用的数量较少。与在实验确定的蛋白质结构中观察到的分布相比,即使是Rosetta方法等成功的结构预测方法也会过度产生低接触阶结构预测。

原生折叠接触序的百分比也可用作折叠过渡状态“原生性”的量度。结合分子动力学的Phi 值分析产生了过渡态模型,其接触序接近于小且快速折叠的蛋白质中的折叠状态。此外,过渡状态下的接触序以及原始状态下的接触序与整体折叠时间高度相关。

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相关阅读:蛋白质的接触序是蛋白质天然状态三级结构中氨基酸间接触位置的量度

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刘嘉琛,字赓南,直隶天津县,清朝政治人物、进士出身。

光绪十一年(1885年)举人,光绪二十一年(1895年)进士。改翰林院庶吉士。光绪二十四年四月,散馆,授翰林院编修。光绪二十六年,任山西学政。光绪二十九年,任国史馆协修;次年,任武英殿协修、文渊阁校理。光绪三十二年,任编书处编修,后署陕西提学使。光绪三十三年,由学部派赴日本游历。宣统元年,任实录馆纂修协办院事。宣统二年,署四川提学使。

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相关阅读:刘嘉琛

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杨暗公旧居位于重庆市潼南县双江镇。又称「邮政局大院」。1987年1月23日列为重庆市第二批市级文物保护单位初定名单。1992年3月19日列为重庆市第二批市级文物保护单位。1996年9月16日公布为四川省第四批省级文物保护单位。2000年9月7日列为第一批重庆市文物保护单位。

「邮政局大院」是杨暗公少年时代的旧居,位于双江镇北街,因其内曾设有「邮政代办局」而得名,是杨家祖上的产业,为双江杨氏家族经营的铺面,后来分家时分到了杨暗公的父亲杨淮清名下,1907年,杨淮清对邮政局进行维修,将这处经商的老宅维修成为现在的前店后院式,前面为邮政局的铺面,后厅做起居地。随后,杨家从乡下全家迁到双江镇的「邮政局大院」居住。大院坐北朝南,占地1600平方米,建筑面积1100平方米,修建于清咸丰年间,系典型的南方晚清悬山顶式民居青瓦建筑。楼阁地板、雕花门窗、土漆壁檐,二进四重,每进辟有大小天井各一,天井两侧建有厢房,组成四合院格局。

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